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小白薯
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动作电位是神经传导、肌肉收缩的重要生理过程,由电压门控离子通道感受。电压门控离子通道是一大类位于细胞膜上、控制离子跨膜进出细胞的蛋白质,包括钙、钾、钠离子通道。电压门控离子通道的功能异常或紊乱与一系列疾病相关,目前是仅次于G蛋白偶联受体(GPCR)的第二大药物靶点。Cav通道可特异性传递钙离子,在胞内,钙离子本身作为信号转导的第二信使,将细胞膜两侧的电信号转化为胞内的化学信号,对神经递质传递、肌肉收缩、基因转录、腺体分泌、自闭症谱系障碍、帕金森病等许多生理功能非常重要。
年1月,颜宁教授课题组在Nature杂志报道了下游肌质网膜上的高通量钙离子通道兔源RyR1的3.8?冷冻电镜结构;12月,在Science杂志报道了电压门控钙离子通道兔源Cav1.1的4.2?分辨率冷冻电镜结构;年9月,颜宁组再次在Nature杂志发表论文,将兔源Cav1.1结构的分辨率提升至3.6?的近原子分辨率,使大部分氨基酸的侧链能够被清晰分辨;10月,在Science杂志再次报道了猪源RyR2的结构。这些结构的解析为理解众多重要生理、病理功能和电压门控离子通道的工作机理奠定了基础,为利用结构进行新型药物设计、筛选和优化提供了参考模板。
年5月30日,颜宁课题组(吴建平博士为共同第一作者和共同通讯作者,现为西湖大学PI)在Cell上发表题为MolecularBasisforLigandModulationofaMammalianVoltage-GatedCa2+Channel的研究长文,通过Cryo-EM解析了兔源Cav1.1结合不同拮抗剂和激动剂的高分辨率结构,为进一步理解相关药物的作用机制、在结构上提供实验和临床数据、对进一步的药物设计提供了重要依据。
在哺乳动物中,共有10个Cav通道,分为三个亚型:Cav1(Cav1.1-Cav1.4),Cav2(Cav2.1-Cav2.3)和Cav3(Cav3.1-Cav3.3)。Cav1通道,也称为L-型Cav或结合二氢吡啶(dihydropyridine)受体的DHPRs,包含多个亚基,包括成孔α1核心亚基,辅助亚基α2δ,β和γ。Cav通道的α1亚基包含2,个氨基酸残基,折叠为4个同源重复序列I-V,每个重复包含六个跨膜区段S1-S6,形成经典的电压控制离子通道(voltagegatedionchannel,VGIC)。每个重复中的S1-S4形成外围电压感应域(voltagesensingdomain,VSD);中心离子传导孔区域主要由S5和S6与选择性过滤器(SF)组成。
由于生理功能的重要性,Cav通道的异常调节或功能障碍与多种神经、心血管、肌肉和精神疾病相关。因此,Cav通道也是重要的药物研究靶标。目前市场上有三种主要类型的L型Ca2+通道拮抗剂应用于临床,分别是二氢吡啶(DHP),苯并噻氮(benzothiazepines,BTZ)和苯烷基胺(phenylalkylamines,PAA)。其中,DHP被广泛用于治疗高血压、心绞痛、早产等。作为BTZ和PAA的原型药物,diltiazem和verapamil广泛用于血管舒张、心绞痛治疗、高血压,以及某些心律失常和心动过速等。DHP拮抗剂主要通过变构效应起作用。拮抗剂有利于失活状态,而激动剂则导致L型Cav通道的长时间开放。但有趣的是,一些与DHP拮抗剂相似的化合物对L型Cav通道却表现出激动剂的作用,如(S)-(–)-BayK(图1)。
图1.具有代表性的DHP拮抗剂(A)和激动剂(B)的化学结构
此前,有课题组解析了与几种DHP拮抗剂和verapamil结合、细菌来源的CavAb晶体结构。CavAb为同源四聚体结构,与真核单链Cav通道的亲缘关系相距甚远。尽管前人有很多对于此类激动剂和拮抗剂的机制做了研究,但是精确识别这些化合物的结构基础仍有待阐明。因此,解析与配体结合的Cav通道结构对于揭示DHP拮抗剂和激动剂的不同作用模式的分子机制研究是必需的。
在本实验室此前的基础上,通过使用cryo-EM技术,颜宁组解析了rCav1.1与DHP拮抗剂nifedipine(N)和激动剂BayK(B)结合的复合物结构,总分辨率分别为2.9?和2.8?(图2);rCav1.1与另外两种代表性BTZ和PAA原型药物,diltiazem(D)和verapamil(V)结合的复合物结构,总分辨率分别为3.0?和2.7?(图2)。
图2.结合不同小分子的兔源Cav1.1结构分析。A.分别结合nifedipine(N),BayK(B),diltiazem(D),andverapamil(V)的Cav1.1Cryo-EMFouriershellcorrelation(FSC)曲线。B.rCav1.1-N.Cryo-EM密度图。C.2.9?的rCav1.1-NCryo-EM结构。
作者发现,结合了配体后,rCav1.1的结构会发生一定的构象改变。而对于以上的四种配体,结构上都有精确的识别机制。这些高分辨率结构的解析确信了BTZ和PAA药物是rCav1.1的核孔阻遏物,解释了两者的抑制效应。由于DHP小分子类似物既有拮抗剂效应,又有激动剂的效应,因此还需要更多结合这些小分子的不同状态的结构,才能完整的阐述相关的分子机制。总的来说,这些结构进一步在原子水平阐述了rCav1.1的分子基础,为临床研究、新药开发等提供了重要的参考价值。
这是颜宁课题组近几年来在离子通道蛋白研究中的又一重要突破。除了钙离子通道外,颜宁课题组还在钠离子通道、钠离子通道与配体等研究中取得过杰出的研究成果(Science
颜宁等揭示动物毒素调控Nav通道的详细结构机制——廖军点评;Science
颜宁组解析人源电压门控钠离子通道蛋白Nav1.4-β1复合物结构)。
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